Instituttets forskning er kjennetegnet av to spesialiserte områder: europeisk integrasjon, med hovedvekt på den politisk-administrative flernivåstrukturen, og styring og ledelse av offentlige institusjoner. Forskningen er organisert gjennom forskningsgrupper, med ekspertise på utvalgte sektorer og områder, slik som høyere utdanning og helsesektoren.
Instituttet har også fått tildeling fra EU- kommisjonen for å drifte Jean Monnet Centre of Excellence Jean Monnet senteret driver med forskning og formidling av EU- relevant tematikk, særlig tema som omhandler EU etter Brexit